草鱼出血病分子流行病学及GCRV多样性研究

• 作者: 吴灶和 杨玉滔 简纪常 闫秀英 雷燕 黄毅昌
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 草鱼呼肠孤病毒 草鱼出血病 分子流行病学 多样性
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 动物科学·饲料科学
• 页码范围: 120-125,153
• 页数: 7页
• 分类号: S941
• 字数: 5996字
• 语种: 中文

摘要

[目的]分析不同基因型GCRV分离株与患草鱼出血病草鱼症状的相关性.[方法]采用RT-PCR检测患病草鱼,应用生物信息学方法分析基因型内和基因型间不同分离株间的差异.[结果]对近3年来草鱼出血病分子流行病学分析发现,患草鱼出血病病鱼多为“肠炎型”症状,且检测发现其病原多属于GCRV基因型Ⅲ型.对GCRV的多样性分析表明,不同分离株同源蛋白的同源率高达93％以上,却被给予完全不同的名称,给GCRV多样性研究带来一定的困难;同一基因型不同分离株同源蛋白间的变异位点较少,且功能位点发生变异的更少;不同基因型不同分离株同源蛋白间的保守位点较少,且这些保守位点中只有极少数位点为功能位点;不同基因型分离株同源结构蛋白间存在较大的差异,且同源非结构蛋白间的差异更为显著.[结论]草鱼出血病不同临床症状可能与其病原基因型不同有关.