不同钾水平下花魔芋差异表达基因分析

• 作者: 亦芾 姜飞 曾黎琼 李娥贤 段玉云 陈玲 韩蓉蓉
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 富源花魔芋 cDNA-SRAP 基因表达 钾水平
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研 究 论 文
• 页码范围: 38-41
• 页数: 4页
• 字数: 2908字
• 语种: 中文

摘要

为了探索魔芋对不同水平钾素营养的反应机制，提取施用低、中、高水平硫酸钾5 d 后的富源花魔芋叶片总 RNA，合成了 cDNA，采用优化的 cDNA-SRAP 技术体系分析了在低钾、中钾、高钾水平下富源花魔芋叶片的差异表达基因，并对其进行了生物信息学分析。结果显示：29对引物组合共扩增出507条基因片段，其中差异片段126条。相对于中钾处理，低钾、高钾处理的差异片段包括抑制型表达片段19条，诱导型表达片段14条，上调表达型片段29条，下调表达型片段64条。选取表达量高的13条差异片段进行回收测序，并在 NCBI 上进行 BLAST 比对，共比对出9条差异片段的同源序列，其中4条与已知功能基因（谷氨酰胺酰-tRNA 合成酶、β-ATP 合成酶、GTP 结合蛋白、核苷酸还原酶）有较高同源性，5条与假定基因或预测基因同源性较高，剩余序列未找到同源序列，可能是一些新的魔芋与钾营养吸收利用相关的基因，具体功能还有待于进一步研究。