利用闪烁直观观察生物大分子三维结构片段

• 作者: 何光源 杨广笑 王攀
• 来源期刊: 华中科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 生物大分子 三维可视化 分子片段 闪烁 Web Jmol
• 年，卷（期）: 2016,（10）
• 所属期刊栏目: 信息与生命科学
• 页码范围: 128-132
• 页数: 5页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.13245/j.hust.161025

摘要

为了克服Rasmol和Jmol等传统工具在局部片段观察方面的缺陷，开发了基于Web利用闪烁直观观察生物大分子三维结构片段的可视化系统。该系统基于 Jmol ，利用 HTML ，Javascript ，PHP和 MySQL 等W eb相关技术，拓展了闪烁片段设置与观察相关功能。拓展功能主要包括：几乎所有的操作通过用户熟悉、使用方便的网页控件而不是传统工具主要采用的文本命令或顶层（或弹出）菜单来完成；同时显示分子序列文本以及单体编号信息，以便对局部片段定位；通过外观状态在隐藏与显示之间来回循环地切换实现片断闪烁效果；与Word或Phoposhop类似，历史操作状态可以通过列表进行撤销或重做，当前状态可以保存到服务器以便后续研究。该系统在实际应用中对专家和新用户都表现出较好效果。