三叶青扩展蛋白家族基因全长cDNA的克隆及其生物信息学和表达分析

• 作者: 向太和 宋亚玲 张挺 李姣姣 武盼 王博
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 三叶青 扩展蛋白基因 克隆 表达 块根
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 810-815
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.05.021

摘要

目的 克隆三叶青Tetrastigma hemsleyanum的扩展蛋白家族基因,对其进行器官表达分析,并初步探讨其功能.方法 根据GenBank中登录的扩展蛋白基因保守区域序列设计1对简并引物,以三叶青球形块根cDNA为模板进行RT-PCR扩增,再结合RACE技术,获得三叶青扩展蛋白基因全长cDNA序列,命名为Th-exp.采用半定量RT-PCR和荧光定量PCR分析Th-exp基因在不同器官中的表达情况.结果 克隆获得扩展蛋白家族基因,共782 bp,其中包含630 bp开放阅读框,编码209个氨基酸(GenBank登陆号KP693606).Th-exp编码的蛋白质具有典型的扩展蛋白结构特征,N端含有8个半胱氨酸的结构域,C端含有4个保守的色氨酸结构域,中间含有组氨酸功能域.Blast分析显示,Th-exp与葡萄、醉蝶花中扩展蛋白基因具有相似性.半定量RT-PCR和荧光定量PCR分析表明,Th-exp在三叶青叶、茎、普通细根和球形块根中均有表达,但球形块根中表达强于其他器官.结论 克隆得到三叶青扩展蛋白家族基因Th-exp全长cDNA,初步预测其参与了三叶青块根的发育过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	向太和	杭州师范大学生命与环境科学学院	32	321	10.0	16.0
2	宋亚玲	杭州师范大学生命与环境科学学院	3	6	2.0	2.0
3	武盼	杭州师范大学生命与环境科学学院	2	3	1.0	1.0
4	王博	杭州师范大学生命与环境科学学院	2	3	1.0	1.0
5	张挺	杭州师范大学生命与环境科学学院	6	2	1.0	1.0
6	李姣姣	杭州师范大学生命与环境科学学院	1	1	1.0	1.0