鸡粪菌渣好氧堆肥过程中氨氧化古菌及氨氧化细菌群落的动态变化

• 作者: 何炎森 张少平 林霜霜 罗涛 翁伯琦 邱珊莲
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: 堆肥 RFLP 氨氧化古菌 氨氧化细菌 丰度 群落结构
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 废弃物处理及资源化利用
• 页码范围: 573-583
• 页数: 11页
• 分类号: X713
• 语种: 中文
• DOI: 10.11654/jaes.2016.03.022

摘要

以amoA 基因为标记，通过Real-Time PCR和限制性片段长度多态性（Restriction fragment length polymorphism，RFLP）法对鸡粪菌渣好氧堆肥过程中的氨氧化古菌（Ammonia-oxidizing archaea, AOA）和氨氧化细菌（Ammonia-oxidizing bacteria, AOB）进行了丰度及群落结构的分析。结果表明，在堆制初期、好氧发酵高温期及后熟期，AOB的amoA 基因丰度均占主导优势，是AOA的38~992倍。进入好氧发酵高温期，AOA amoA 基因丰度下降至发酵前的0.9%，AOB下降至17.6%，后熟期AOA与AOB的amoA基因丰度与好氧发酵高温期相当。在上述3个阶段AOA与AOB各自存在一个绝对优势菌群，分别为Cluster 3和Nitrosomonas europaea，其中Cluster 3克隆子数目分别占整个克隆文库的70.73%、54.28%、72.45%，Nitrosomonas europaea克隆子数目分别占整个克隆文库的78.44%、93.20%、94.27%。堆肥3个阶段AOA的多样性指数变化不大，Shannon-Wiener值维持在1.53~1.60，但群落结构发生明显演替，随着堆肥温度升高，堆肥前期的一些菌群（Cluster 4、Cluster 5、Cluster 6）逐渐消失，新的菌群Cluster 1出现并成为堆肥中后期的第二大优势菌群。AOB无论是多样性指数还是群落组成，都发生剧烈的变化。AOB在堆肥前期Shannon-Wiener指数值最大（1.47），种群数最多（6个基因簇，分别为 Nitrosomonas europaea Cluster，Nitrosomonas halophila Cluster，Nitrosomonas communis Cluster，Nitrosomonas nitrosa Cluster，Nitrosospira briensis Cluster，Nitrosospira multiformis Cluster）；进入高温发酵期，Shannon-Wiener下降至0.45，群落结构单一，只有Nitrosomonas europaea Cluster和Nitrosomonas halophila Cluster；进入后熟期，AOB多样性及种群数得到一定程度的回升。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翁伯琦		525	5329	31.0	50.0
2	罗涛	福建省农业科学院土壤肥料研究所	102	938	18.0	24.0
3	何炎森	福建省农业科学院亚热带农业研究所	49	341	10.0	16.0
4	张少平	福建省农业科学院亚热带农业研究所	91	247	8.0	10.0
5	邱珊莲	福建省农业科学院亚热带农业研究所	69	275	9.0	14.0
6	林霜霜	福建省农业科学院亚热带农业研究所	17	52	5.0	6.0