SARS-CoV、SARSL-CoV与其他冠状病毒的种系发生分析

• 作者: 丁记者 何剑锋 徐德忠 朱静媛 李庆波 段广才
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: SARS病毒 冠状病毒科 系统分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 107-111,128
• 分类号: R394.3|R181
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.02.001

摘要

目的 分析不同流行时段重症急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndromes coronavirus,SARS-CoV)病毒株与重症急性呼吸综合征样冠状病毒(severe acute respiratory syndromes like coronavirus,SARSLCoV)及其他冠状病毒的分子进化关系.方法 从美国国立生物技术信息中心获取不同分离时段的SARS-CoV(9条)、所有SARSL-CoV(24条)、其他冠状病毒(26条)的全基因组序列,用ClustalX 2.1软件进行多重序列比对,用邻接法(neighbor-joining,NJ) MEGA 6.0软件构建系统进化树.结果 在包含SARS-CoV、SARSL-CoV和其他冠状病毒基因组序列的不同数据集中,流行早、中期SARS-CoV与流行末期毒株的基因组序列均分别属于不同的分支;以流行早、中期SARS-CoV为根的有根树显示,流行末期SARS-CoV遗传距离最远,而与SARSL-CoV和其他冠状病毒遗传距离更接近.结论 流行末期SARS-CoV与流行早、中期SARS-CoV遗传差异大,且可能存在逆向/返祖进化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐德忠	第四军医大学预防系流行病学教研室	165	1677	21.0	30.0
2	朱静媛	郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室	33	232	9.0	13.0
3	丁记者	郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室	4	15	3.0	3.0
4	李庆波	郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室	4	15	3.0	3.0
5	何剑锋	广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所	3	17	2.0	3.0