绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测

• 作者: 储明星 刘秋月 曹晓涵 潘章源 狄冉 王翔宇 胡文萍 贺小云 郭晓飞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 GDF9基因 mRNA 调控区 遗传多态性
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1555-1564
• 页数: 10页
• 分类号: S826|S821.2
• 字数: 5079字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2016.08.005

摘要

本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9 (Growth differentiation factor 9,GDF9)基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系.首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性.结果显示,克隆获得GDF9基因mRNA全长1 852 bp(GenBank序列号:KR063137),编码区两侧翼分别具有5'-UTR58 bp(1～58 nt)和3 ' UTR 432 bp(1 421～1 852 nt).进一步克隆获得长为2 898 bp的DNA序列和2 304 bp的调控区序列,分析发现调控区序列比数据库序列(NC_019462.1)多两个长片段.序列比对发现了已知突变G260A(G1)和调控区新突变-2078C＞G.分型结果显示,11个绵羊品种均不含FecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突变,而G260A和-2078C＞G广泛存在于除草原型藏羊外的各绵羊品种中,G260A表现3种基因型(AA、BB和AB),首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中检测到BB型突变纯合子.-2078C＞G也存在3种基因型,基因型结果表明该位点与G260A完全连锁.关联分析结果显示,小尾寒羊AB型产羔数显著高于AA型(P＜0.05).本研究完善了绵羊GDF9 mRNA、DNA和调控区全长序列,为进一步研究GDF9基因功能奠定了基础.同时在不同绵羊品种中发现了G260A和-2078C＞G突变,其中G260A作为潜在的有效遗传标记可用于提高绵羊的产羔数.