缺血性脑卒中患者外周血miRNA生物信息学分析研究

• 作者: 欧世宁 秦超 胡瑞婷 覃东华
• 来源期刊: 广西医学
• 学科: 医学
• 关键词: 缺血性脑卒中 微小RNA 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 论著·基础研究
• 页码范围: 759-761,765
• 页数: 4页
• 分类号: R743.3
• 字数: 2813字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11675/j.issn.0253-4304.2016.06.02

摘要

目的 应用生物信息学技术分析缺血性脑卒中患者外周血中微小RNA(miRNA)的靶基因及其功能、在疾病中的作用.方法 在GEO数据库中检索缺血性脑卒中基因芯片数据,并利用生物信息学工具筛选差异表达的miRNA,对差异表达的miRNA进行靶基因预测分析,对miRNA靶基因进行生物学功能分析及信号通路分析,最后构建miRNA调控网络和miRNA靶基因调控网络.结果 检索到芯片数据GSE55937,筛选得到50个差异表达的miRNA.筛选出的miRNA的靶基因的合集共7 557个.这些靶基因的功能主要为DNA依赖转录、DNA依赖转录调节等,主要分布在丝裂原活化蛋白激酶信号通路、肿瘤信号通路等信号通路miRNA功能的调控分析及miRNA靶基因调控网络图提示,人类miRNA(hsa-miR)-15a-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7 i-5p、hsa-let-7 g-5p中心度最高.结论 缺血性脑卒中患者外周血中存在差异性表达的miRNA,hsa-miR-15a-5p、hsa-miR-106b-5p、hsa-let-7c-5p、hsa-let-7i-5p、hsa-let-7g-5p与缺血性脑卒中的发病密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦超	广西医科大学第一附属医院神经内科	141	596	12.0	16.0
2	胡瑞婷	广西医科大学附属民族医院神经内二科	3	13	2.0	3.0
3	欧世宁	广西医科大学附属民族医院神经内二科	5	16	3.0	4.0
4	覃东华	广西医科大学附属民族医院神经内二科	5	12	2.0	3.0