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摘要:
维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因.本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息.同时,采集5个种群共54只高原鼢鼠,对vkorc1基因全序列进行测序分析.结果显示,从转录组组装结果中成功获得5种动物的vkorc1基因编码区全序列,其中青海田鼠、长尾仓鼠、高原鼢鼠vkorc1基因编码区长度为486 bp,喜马拉雅旱獭和高原鼠兔为492 bp;在DNA序列水平上,5种高原动物存在143个变异位点,与大鼠的序列相似性为80.1%~90.7%,而与小鼠的序列相似性为79.7%~89.8%.在氨基酸序列水平上,5种高原动物存在37个变异位点,大鼠的序列相似性为84.0%~92.0%,而与小鼠的序列相似性为85.9%~92.0%;未发现与已知抗凝血杀鼠剂抗性相关的氨基酸位点.对5个种群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的测序分析显示,比对后的全长为1 808 bp,共检测到8个变异位点,其中两个为插入缺失位点,全部变异都发生在内合子区.本研究首次以基因序列为分析对象,可以为青藏高原地区的鼠害防治提供关键基础资料.
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析
来源期刊 草业科学 学科 农学
关键词 抗凝血杀鼠剂抗药性 vkorc1 序列变异 青藏高原 高原鼢鼠
年,卷(期) 2016,(6) 所属期刊栏目 动物生产层
研究方向 页码范围 1206-1212
页数 7页 分类号 S812.6
字数 4764字 语种 中文
DOI 10.11829/j.issn.1001-0629.2015-0644
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 苏建平 中国科学院西北高原生物研究所 79 1319 20.0 33.0
2 张同作 中国科学院西北高原生物研究所 48 518 13.0 20.0
3 李生庆 37 81 5.0 6.0
4 李志宁 32 42 3.0 3.0
5 林恭华 中国科学院西北高原生物研究所 30 111 6.0 8.0
6 赵芳 中国科学院西北高原生物研究所 13 62 5.0 7.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
抗凝血杀鼠剂抗药性
vkorc1
序列变异
青藏高原
高原鼢鼠
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业科学
月刊
1001-0629
62-1069/S
大16开
兰州市嘉峪关西路768号
54-51
1984
chi
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