青藏高原5种害鼠vkorc1基因的测序分析

• 作者: 张同作 慈海鑫 李志宁 李生庆 林恭华 苏建平 赵芳
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 抗凝血杀鼠剂抗药性 vkorc1 序列变异 青藏高原 高原鼢鼠
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 动物生产层
• 页码范围: 1206-1212
• 页数: 7页
• 分类号: S812.6
• 字数: 4764字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2015-0644

摘要

维生素K环氧化物还原酶复合物1基因(vkorc1)的变异是导致鼠类对抗凝血杀鼠剂产生抗性的主要原因.本研究利用转录组测序的方法,分析青藏高原地区5种主要害鼠——高原鼢鼠(Eospalax baileyi)、高原鼠兔(Ochotona curzoniae)、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)、青海田鼠(Lasiopodomys fuscus)和喜马拉雅旱獭(Marmota himalayana)的vkorc1基因序列信息.同时,采集5个种群共54只高原鼢鼠,对vkorc1基因全序列进行测序分析.结果显示,从转录组组装结果中成功获得5种动物的vkorc1基因编码区全序列,其中青海田鼠、长尾仓鼠、高原鼢鼠vkorc1基因编码区长度为486 bp,喜马拉雅旱獭和高原鼠兔为492 bp;在DNA序列水平上,5种高原动物存在143个变异位点,与大鼠的序列相似性为80.1％～90.7％,而与小鼠的序列相似性为79.7％～89.8％.在氨基酸序列水平上,5种高原动物存在37个变异位点,大鼠的序列相似性为84.0％～92.0％,而与小鼠的序列相似性为85.9％～92.0％;未发现与已知抗凝血杀鼠剂抗性相关的氨基酸位点.对5个种群54只高原鼢鼠vkorc1基因全序列的测序分析显示,比对后的全长为1 808 bp,共检测到8个变异位点,其中两个为插入缺失位点,全部变异都发生在内合子区.本研究首次以基因序列为分析对象,可以为青藏高原地区的鼠害防治提供关键基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏建平	中国科学院西北高原生物研究所	79	1319	20.0	33.0
2	张同作	中国科学院西北高原生物研究所	48	518	13.0	20.0
3	李生庆		37	81	5.0	6.0
4	李志宁		32	42	3.0	3.0
5	林恭华	中国科学院西北高原生物研究所	30	111	6.0	8.0
6	赵芳	中国科学院西北高原生物研究所	13	62	5.0	7.0