基于分数阶高斯噪声的DNA序列Hurst指数估计

• 作者: 张培栋 李明
• 来源期刊: 信息技术
• 学科: 工学
• 关键词: 信息处理 DNA序列 分数阶高斯噪声 Hurst指数
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 基金项目
• 页码范围: 11-13
• 页数: 3页
• 分类号: TN915
• 字数: 1486字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13274/j.cnki.hdzj.2016.06.004

摘要

DNA(Deoxyribonucleic acid)序列具有长相关性的特征.对于一个长相关时间序列,Hurst指数是其长相关性的度量.一段DNA序列的长相关性可以通过计算其Hurst指数来说明.首先,选取一段DNA序列通过CGR(chaos game representation)方法将DNA序列转化为对应的时间序列,再通过分数阶高斯噪声模型(fractional Gaussian noise,FGN)进行拟合,基于自相关函数回归法估计Hurst指数.最终的Hurst指数估计结果说明DNA序列确实具有长相关特性,而且对其频谱的分析显示,DNA序列的频谱具有一定的周期性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李明	华东师范大学信息科学技术学院	50	714	14.0	25.0
2	张培栋	华东师范大学信息科学技术学院	1	1	1.0	1.0