虾脊兰属植物 DNA 条形码的确立

• 作者: 任阳阳 刘霞 张嘉丽 张晓存 张梦婷 樊佳佳 王俊
• 来源期刊: 世界中医药
• 学科: 医学
• 关键词: DNA条形码 ITS2 psbA-trnH matK 虾脊兰属
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 中药研究
• 页码范围: 2425-2429
• 页数: 5页
• 分类号: R282.5
• 字数: 3912字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-7202.2016.11.058

摘要

目的：结合ITS2、psbA-trnH和matk序列对兰科虾脊兰属植物进行物种区分鉴定研究，并确立能准确鉴别虾脊兰属植物的序列或者序列组合。方法：采用试剂盒法对已收集的6种虾脊兰属植物进行总DNA的提取，通过扩增及测序，运用codencodeV4.2软件对所得序列进行拼接与剪切，使用MEGA5.0对ITS2、psbA-trnH和matk序列3种序列分别进行比对分析，计算种内及种间Kimura 2-parameter（K2P）遗传距离，构建Neighbor-joining（NJ）系统聚类树。结果：实验共得到序列56条（包含GenBank序列17条），ITS2序列和matK序列其种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离，而该属psbA-trnH序列种内遗传距离范围和种间遗传距离范围有重合。结论：ITS2序列和matK序列可以作为虾脊兰属部分植物的鉴定序列，而psbA-trnH序列不能用于虾脊兰属植物的鉴定。