香蕉MaTPS4基因序列及表达特性分析

• 作者: 孙威 宋顺 徐碧玉 李科明 王安邦 许桂莺 邢文婷 陈青
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 海藻糖-6-磷酸合成酶基因(TPS4) 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 532-538
• 页数: 7页
• 分类号: S668.1
• 字数: 5536字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2016.03.017

摘要

通过随机克隆测序法从香蕉根系cDNA文库中获得海藻糖合成酶基因,命名为MaTPS4,全长cDNA序列为2930bp,含一个完整的开放阅读框2574bp,编码857个氨基酸.生物学信息分析表明,MaTPS4蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,p15.59,结构域TPS和TPP.序列预测分析表明,MaTPS4蛋白定位于细胞质中,具有3个跨膜区域,不存在信号肽.与其他已知植物TPS氨基酸序列同源比对,同源性达到84.90％;进化关系分析表明,香蕉MaTPS4氨基酸与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)聚为一类,二者亲缘关系较近,同源性为99％.器官特异性分析表明,MaTPS4在香蕉根系、球茎、假茎、叶、花、果实各器官中均有表达,其中球茎、假茎、叶片和花中表达量较大,根及果实中表达量极少.qRT-PCR分析表明,MaTPS4在根系中的表达经干旱、盐胁迫后均增强,其中盐胁迫24h时MaTPS4表达量较0h时高5倍;冷胁迫下,MaTPS4表达量增加,并随时间延长下降,在6h达到最大;ABA胁迫下,MaTPS4表达量增加,为0h的5倍;在ACC和FocTR4胁迫下,MaTPS4表达无变化.因此,MaTPS4可能通过依赖ABA途径调控抗逆胁迫相关基因表达,提高植株对非生物胁迫的抗逆性.