基于SNP互作识别潜在冠心病致病基因

• 作者: 吕俊杰 姜晶 张一骅 李怡然 李琬 谢瑞强 赵锡磊 陈彬彬 黄昊
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: SNP 互作 模块 冠心病
• 年，卷（期）: 2016,（21）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 4156-4158
• 分类号: R541.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2016.21.042

摘要

目的:基于全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS)数据与生物信息学方法,识别冠心病潜在致病基因.方法:利用生物信息学方法和GWAS数据,对单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)进-疾病风险打分,依据特定距离阈值内的SNP-SNP互作关系,筛选出疾病相关SNP显著风险模块,识别潜在致病基因.结果:设定阈值20kb,经筛选获得279个SNP显著风险模块,映射到79个基因,文献验证率为71.01％.结论:基于SNP互作识别的潜在致病基因,能更加准确的分析冠心病的发生发展过程.