基于遗传模拟退火混合算法的RNA二级结构预测

• 作者: 凌青华 宋余庆 黄进
• 来源期刊: 软件导刊
• 学科: 工学
• 关键词: RNA二级结构 最小自由能 茎区 遗传算法 模拟退火算法
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 算法与语言
• 页码范围: 27-30
• 页数: 4页
• 分类号: TP312
• 字数: 3572字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11907/rjdk.161267

摘要

RNA二级结构预测是生物信息学中非常重要的内容.RNA二级结构的准确预测有助于生物研究者了解RNA分子在生物体内中所起到的重要作用.近年来,基于最小自由能模型的启发式算法常被运用于预测RNA二级结构.遗传算法和模拟退火算法是常见的启发式算法,将遗传算法中的遗传变异机制以及模拟退火的退火机制相结合,形成一种新的算法,以茎区作为种群中的个体进行交叉变异操作,将所得到的结果进行退火操作,从而得到最优解.该算法结合了遗传算法和模拟退火算法的优势,实验结果表明,该方法预测结果具有较高的精度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋余庆	江苏大学计算机科学与通信工程学院	128	1213	20.0	29.0
2	凌青华	江苏大学计算机科学与通信工程学院	4	2	1.0	1.0
3	黄进	江苏大学计算机科学与通信工程学院	1	0	0.0	0.0