大鼠心力衰竭细胞 microRNA 表达谱及生物信息学分析

• 作者: 何淑芳 张野 朱海娟 胡军 金世云
• 来源期刊: 中华急诊医学杂志
• 关键词: 心力衰竭 心肌细胞 microRNA表达谱 生物信息学分析 荧光定量RT-PCR 靶基因 基因组 KEGG通路
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 439-443
• 页数: 5页
• 字数: 3359字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1671-0282.2016.04.009

摘要

目的：观察大鼠心力衰竭细胞中microRNA （ miRNA）表达变化，利用生物信息学分析技术探索差异miRNA靶基因的功能。方法18只成年雄性SD大鼠，体质量200～220g，随机数字表法随机分为两组：正常对照组（ CON组）和心力衰竭组（ HF组）。 HF组制备阿霉素致心力衰竭模型， CON组注射等量生理盐水。提取大鼠心脏， Largendorff逆行灌注法分离心室肌细胞，提取总RNA行miRNA表达谱检测，筛选两组差异表达的miRNA，荧光定量RT-PCR 技术验证结果， Targetscan、 miRanda软件预测差异表达miRNA的靶基因，并对靶基因行生物信息学分析。结果芯片检测结果显示，与CON组相比， HF组共有37个miRNA表达发生显著改变，其中22个miRNA上调，15个miRNA下调（均P＜0.01， FDR＜0.05）。荧光定量RT-PCR检测miR-133b-5p （t ＝14.56， P＜0.1）、 miR-6216（t＝9.32， P＜0.1）、 let-7e-5p （ t＝13.92， P＜0.1）表达水平，变化趋势与芯片结果一致。生物信息学分析显示，差异表达miRNA调控的靶基因显著富集于31个基因组（均P＜0.01， FDR＜0.05）和12条信号通路（均P＜0.05， FDR＜0.05），其中泛素蛋白酶体系统、 MAPK信号通路、 Toll样受体信号通路富集程度较高。结论阿霉素诱导的心力衰竭模型大鼠心肌细胞中miRNA表达谱发生显著改变，这些差异表达miRNA可能通过调控靶基因功能参与心力衰竭的病理生理过程。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张野	安徽医科大学第二附属医院麻醉科	175	1130	15.0	25.0
2	何淑芳	安徽医科大学第二附属医院麻醉科	35	145	7.0	9.0
3	金世云	安徽医科大学第二附属医院麻醉科	14	69	5.0	7.0
4	胡军	安徽医科大学第二附属医院麻醉科	12	59	4.0	7.0
5	朱海娟	安徽省妇幼保健院麻醉科	2	4	1.0	2.0