河南和河北冬小麦区假禾谷镰孢的遗传多样性

• 作者: 周海峰 孙炳剑 施艳 李洪连 袁虹霞 贺小伦
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: ISSR 假禾谷镰孢 小麦茎基腐病 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 272-281
• 页数: 10页
• 字数: 6680字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2016.02.008

摘要

【目的】运用ISSR-PCR技术揭示中国河南和河北省冬小麦区6个地理群体小麦茎基腐病优势病原菌假禾谷镰孢（Fusarium pseudograminearum）的遗传多样性。【方法】利用筛选的17个ISSR引物对从河南和河北冬小麦区收集的166株假禾谷镰孢菌株进行扩增。根据群体扩增的结果，用POPGENE version l.32软件计算各项遗传多样性参数。根据不同地理群体的遗传相似系数，用NTSYSpc version 2.11软件进行群体聚类分析。【结果】从97个ISSR引物中筛选出了17个多态性较好的引物，用这17个引物对河南和河北冬小麦区的166株假禾谷镰孢菌株进行扩增，共扩增出234个DNA片段，其中多态性位点为218个，占总扩增片段的93.16%。平均每个引物可以扩增出13.76个条带，扩增产物大小在150—2500 bp。POPGENE分析表明，6个地理群体的多态位点数在58—208，平均为124；多态位点百分率在24.79%—88.89%，平均为52.92%；有效等位基因数在1.1548—1.3293，平均为1.2584。遗传多样性分析表明，在地理种群水平上，Nei’s 基因多样性指数在0.0897—0.2069，平均为0.1548；Shannon’s信息指数在0.1337—0.3257，平均为0.2368，这表明不同地理群体间存在一定的遗传变异。河南北部地区的 Shannon’s 信息指数和 Nei’s 基因多样性指数最高，表明该地区假禾谷镰孢菌株之间的遗传多样性最丰富。河南南部地区的 Shannon’s 信息指数和 Nei’s 基因多样性指数最低，表明该地区假禾谷镰孢菌株之间的遗传多样性最低。遗传相似性分析证明，河南北部地区假禾谷镰孢种群和河南东部地区种群最近，河南南部地区假禾谷镰孢种群和河南东部地区种群最远。6个地理群体间的遗传分化系数Gst为0.1571，群体内为0.8429，群体内多样性大于群体间的多样性。6个地理群体间的基因流Nm为2.6819，说明不同地理群体假禾谷镰孢菌株间存在较大的基因流动。6个地理群体总基因多样度Ht为0.1837，各地理群体内基因多样度Hs为0.1548，地理群体间基因多样度Dst为0.0289，这说明相同地理来源的菌株有具有较近的亲缘关系。在遗传相似系数为0.966时，可将6个地理群体划分为2个不同的类群。第Ⅰ类群包括河南北部、河南东部、河南中部、河北中部和河南西部地区，河南南部地区属于第II类群。【结论】河南和河北冬小麦区小麦茎基腐病假禾谷镰孢6个地理群体之间的遗传分化与其地理来源之间有一定的相关性，群体内多样性大于群体间，不同地理群体假禾谷镰孢菌株间存在较大的基因流动。