ITS2条形码序列对海南大戟科植物的鉴定

• 作者: 唐历波 徐腊红 李栎
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 大戟科 ITS2 DNA条形码 鉴定 PCR测序
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1572-1577
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2016.09.021

摘要

目的 利用DNA条形码技术评估ITS2序列对海南大戟科植物的鉴定能力.方法 利用PCR测序法,对供试样本ITS2片段进行双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,利用MEGA 6.0进行相关数据分析,构建邻接(NJ)树.利用TAXON DNA软件分析序列种内、种间变异并作barcoding gap分析.从ITS2数据库中获得供试样本的预测ITS2二级结构.结果 大戟科供试样本ITS2序列中变异位点与信息位点分别占总序列长度的84％和69.67％.供试各种在构建的NJ树中均各自成束,表现出单系性;基于ITS2序列的种内最大变异距离值0.067 3;种间最小变异距离值0.119 1,各ITS2二级结构种内无明显差异;种间存在明显差异.结论 所得ITS2条形码序列对海南大戟科植物鉴定能力强,可作为DNA条形码序列对海南大戟科植物进行快速鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐历波	海南医学院理学院	13	67	4.0	7.0
2	李栎	海南医学院理学院	19	70	4.0	7.0
3	徐腊红	中山大学生命科学学院	1	5	1.0	1.0