南美白对虾体表与肠道细菌菌群结构的DGGE分析

• 作者: 唐宏刚 张云鹏 朱立颖 王欣 肖朝耿 陈黎洪 顾青
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 南美白对虾 肠道菌群结构 体表菌群结构 DGGE
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 食品安全与检测
• 页码范围: 218-224
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2016.08.030

摘要

采用DGGE技术对南美白对虾体表与肠道的4个部位进行细菌菌群结构分析,结果表明:粪肠球菌和假单胞菌属是南美白对虾肠道细菌的主要成员;葡萄球菌属是体表的优势菌,尤其在腹部占据了绝对优势,包含3个菌种:表皮葡萄球菌、科氏葡萄球菌和巴氏葡萄球菌.不同部位的体表细菌存在差异,头胸部的葡萄球菌比腹部少,只有科氏葡萄球菌,而粪肠球菌与希瓦氏菌比腹部的多.头胸部有鳃,而腹部存在甲壳节与节的连接膜,这些生理结构的差异导致体表细菌菌群结构不同.DGGE图谱还揭示出一些常见的腐败菌分布是不同的,拟态弧菌和豚鼠气单胞菌只存在与肠道中,而希瓦氏菌属仅在体表被检测到.假单胞菌属的不同菌种在南美白对虾的体表与肠道有不同分布,DGGE甚至能检测到出现在体表与肠道的粪肠球菌的菌株不同.这些结果表明DGGE在菌株鉴定方面具有很高的灵敏性,有可能应用在腐败菌溯源方面.