基于高通量测序的肉牛垫料养殖床中细菌群落分析

• 作者: 吴淑杭 周德平 姜震方 褚长彬 赵峥
• 来源期刊: 上海农业科技
• 关键词: 垫料养殖 肉牛 细菌种群结构 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 专题研究
• 页码范围: 26-27,41
• 页数: 3页
• 字数: 1647字
• 语种: 中文

摘要

利用Roche 454GSFLX+高通量测序平台分析了肉牛垫料养殖床中的细菌群落结构,结果显示,从发酵床样品中共获得17 772条有效序列,其中优质序列有13 301条,在97％相似水平上聚为1 603个OTU分类单元;目水平上,细菌优势种群集中在芽孢杆菌目(21.70％)、红螺菌目(18.20％)、乳杆菌目(14.90％)、梭菌目(14.10％)、黄杆菌目(10.50％)、伯克氏菌目(5.50％)、黄单胞菌目(3.00％)、放线菌目(2.10％)和根瘤菌目(1.80％);属水平上,细菌的优势种群主要集中于醋酸杆菌属(1 5.17％)、金黄杆菌属(9.50％)、乳杆菌属(6.90％)、芽孢杆菌属(6.30％)、乳球菌属(6.0％)、高温放线菌属(3.50％)、类芽孢杆菌属(2.40％)、梭菌目(2.10％)、伯克氏菌属(2.10％)和葡萄糖醋杆菌属(1.80％).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴淑杭	上海市农业科学院生态环境研究所	64	870	19.0	28.0
2	周德平	上海市农业科学院生态环境研究所	48	534	15.0	22.0
4	姜震方	上海市农业科学院生态环境研究所	36	623	15.0	24.0
5	褚长彬	上海市农业科学院生态环境研究所	33	247	9.0	15.0
6	赵峥	上海市农业科学院生态环境研究所	15	36	4.0	5.0