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面向疾病分类的人类互作网络拓扑模块的功能同质性分析
面向疾病分类的人类互作网络拓扑模块的功能同质性分析
作者:
刘光明
周雪忠
王宁
王惠欣
高盼盼
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
网络医学
疾病分类
GO富集分析
蛋白功能模块
拓扑模块
Mesh
String9
摘要:
鉴于网络医学中尚未有对疾病分类与功能蛋白模块功能同质性分析之间关系的研究,展开以下研究工作:首先,利用Mesh、String9等数据库中的数据构建了基因关系网络;其次,采用基于优化模块度的模块划分方法(如BGLL、非负矩阵分解(NMF)等聚类算法)对基因关系网络进行了划分;再次,对划分出来的模块进行了GO富集分析,通过对高致病拓扑模块和低致病拓扑模块的GO富集分析的比较,发现了疾病分类和蛋白模块功能特性在生物过程、细胞组分、分子功能等方面存在重要的生物学提示;最后,分析了疾病分类的拓扑模块的功能特性,通过对网络拓扑性质如平均度、密度、平均最短路径长度等方面的分析得到了各模块的功能特点数据,进一步揭示了疾病分类和功能模块之间的相关关系.
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文献信息
篇名
面向疾病分类的人类互作网络拓扑模块的功能同质性分析
来源期刊
计算机应用
学科
工学
关键词
网络医学
疾病分类
GO富集分析
蛋白功能模块
拓扑模块
Mesh
String9
年,卷(期)
2016,(8)
所属期刊栏目
第六届中国数据挖掘会议(CCDM 2016)
研究方向
页码范围
2144-2149,2169
页数
7页
分类号
TP399
字数
6222字
语种
中文
DOI
10.11772/j.issn.1001-9081.2016.08.2144
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
周雪忠
北京交通大学计算机与信息技术学院
53
1039
17.0
31.0
2
王宁
北京交通大学计算机与信息技术学院
24
132
7.0
11.0
3
高盼盼
北京交通大学计算机与信息技术学院
2
2
1.0
1.0
4
刘光明
北京交通大学计算机与信息技术学院
3
4
1.0
1.0
5
王惠欣
北京交通大学计算机与信息技术学院
1
1
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传播情况
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
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同被引文献
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参考文献(2)
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参考文献(1)
二级参考文献(0)
2014(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2016(0)
参考文献(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
网络医学
疾病分类
GO富集分析
蛋白功能模块
拓扑模块
Mesh
String9
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
计算机应用
主办单位:
四川省计算机学会
中国科学院成都分院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-9081
CN:
51-1307/TP
开本:
大16开
出版地:
成都237信箱
邮发代号:
62-110
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
20189
总下载数(次)
40
总被引数(次)
209512
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