桂花查耳酮合酶chs基因的克隆及序列分析

• 作者: 徐秀荣 臧德奎 马燕
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 桂花 查耳酮合酶基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 林学·园艺
• 页码范围: 118-124
• 分类号: S685.13
• 语种: 中文

摘要

克隆与桂花(Osmanthus fragrans)花色形成相关基因查耳酮合酶(Ofchs),并对该基因的序列特征、进化关系进行分析,为探究该基因在桂花花色形成中的功能提供理论依据.以桂花‘丹桂’品种为试材,采用RT-PCR和RACE方法克隆丹桂查耳酮合酶(chalcone synthase,chs)基因eDNA全长.利用NCBI和DNAMAN分析软件,对该基因进行核苷酸序列以及氨基酸序列的分析,利用DNAMAN软件直接构建系统进化树,以分析该基因在不同物种间的进化关系.结果表明:从‘丹桂’花瓣中成功获得了1个丹桂查耳酮合酶基因cDNA全长,该基因全长为1383 bp,包含48bp的5'非编码区、162 bp的3'非编码区和1个长度为1173 bp编码390个氨基酸的开放阅读框.序列分析表明,该基因具有Cys164、His303和Asn336 3个活性位点及2个决定底物特异性的苯丙氨酸残基Phe215、Phe265.该基因也具有查尔酮合酶家族的2条特征多肽序列:RFMMYQQGCFAGGTVLR和GVLFGFGPGL.Blast序列分析显示,该基因与同属木犀科的油橄榄相似性达95％,与其他双子叶植物的相似性达72％～76％.克隆出的丹桂chs基因属于查尔酮合酶家族,系统进化分析表明,该基因聚类具有明显的种属特性,桂花与唇形科等植物的chs亲缘关系较近,相似性达76％以上,符合植物分类学分类,为今后探究该基因在花色行形成中的作用机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	臧德奎	山东农业大学林学院	118	1308	20.0	31.0
2	马燕	山东农业大学林学院	29	189	7.0	13.0
3	徐秀荣	山东农业大学林学院	3	12	2.0	3.0