盐碱胁迫下玉米EST数据库对比分析

• 作者: 俞晨 周鸣鸣 张洁 李德全 汪亚玲 王顺 蔡洪玉 谈蓉 豆长明 赵德兵
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 盐胁迫 碱胁迫 EST 生理功能
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 60-61,62
• 页数: 3页
• 分类号: S513.03
• 字数: 3593字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2016.02.016

摘要

提取了盐碱胁迫处理的玉米YQ7－96品系3叶1心期的叶茎混合组织总 RNA，运用 SMART技术构建pDNR－LIB载体的cDNA文库，并随机挑选克隆进行EST序列的BlastX比对和MIPS归类分析。结果发现，在随机挑取的2个4000个cDNA克隆测序中，95．0％的EST符合分析要求（长度大于150 bp，非rRNA），共获得3217条拥有BlastX注释信息的EST序列，盐碱胁迫的EST数据库归类的比例信息比较接近。其中维持正常生理活动占比分别为50．63％（盐胁迫）和52．79％（碱胁迫），参与细胞内运输、细胞内信号传导、细胞防御和细胞循环和DNA代谢过程的基因分别为22．05％（盐胁迫）、19．03％（碱胁迫），参与能量代谢和转录相关的基因分别为15．77％（盐胁迫）、15．36％（碱胁迫）。本研究构建的盐碱胁迫下玉米cDNA文库及相关基因表达分析结果，为后续研究提供了基础数据。