湖羊SPLUNC1基因序列的生物信息学分析

• 作者: 孙延鸣 沈文 郭海英 陈冬梅 陈凯丽
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 湖羊 短的上腭 肺及鼻咽上皮克隆1(SPLUNC1) 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 48-50,51
• 页数: 4页
• 分类号: Q781
• 字数: 3490字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2016.02.012

摘要

以湖羊SPLUNC1基因为研究对象，利用生物信息学方法对其编码的蛋白进行理化性质、信号肽、跨膜区域、亚细胞定位、二级结构、三级结构、保守区域分析，并构建系统发育树。结果表明，湖羊 SPLUNC1蛋白的分子量为26．53 ku，理论等电点为5．07。SPLUNC1蛋白N端存在信号肽，亚细胞定位在细胞外。SPLUNC1蛋白质的二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲。该蛋白由4股反平行的肽段形成的β折叠片和2个α螺旋组成的桶形结构域组成。系统发育树分析表明，湖羊的SPLUNC1蛋白在山羊、牛、猪、人、小鼠中，与山羊首先聚为一类，后与牛聚为一类，这与动物学分类结果一致。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙延鸣	石河子大学动物科技学院	70	257	8.0	12.0
2	沈文	石河子大学动物科技学院	33	105	5.0	8.0
3	陈冬梅	石河子大学动物科技学院	17	70	5.0	7.0
4	郭海英	石河子大学动物科技学院	9	21	3.0	4.0
5	陈凯丽	石河子大学生命科学学院	14	21	3.0	4.0