肾综合征出血热患者血浆cf-DNA特征及其深度测序分析

• 作者: 孙艺祯 庄然 张圆 张宇丝 易静 李琦 金伯泉 马樱
• 来源期刊: 科学技术与工程
• 学科: 医学
• 关键词: 游离脱氧核糖核酸 肾综合征出血热 汉滩病毒 胱氧核糖核酸测序
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 医药、卫生
• 页码范围: 151-155,161
• 页数: 6页
• 分类号: R373.3
• 字数: 4865字
• 语种: 中文

摘要

探讨肾综合征出血热(HFRS)患者血浆cf-DNA含量与不同病情、病期等指标的相关性,定性分析游离DNA (cf-DNA)的来源与特征.收集了47例HFRS不同病情患者不同病程的128份血浆标本,以及20例健康志愿者的20份血浆标本.定量分析血浆总cf-DNA水平,提取纯化cf-DNA后进行定性分析,对其中9份HFRS患者血浆标本进行DNA高通量测序和生物信息学分析.统计学分析各参数指标间相关性.健康人血浆cf-DNA水平中位数为919.0 ng/mL,HFRS患者血浆cf-DNA含量明显增高,随着病程进展呈现动态变化的规律.轻型/中型患者与重型/危重型患者有着明显不同的分布格局:发热期cf-DNA水平即明显高于健康对照,在低血压休克期达到峰值,然后逐步下降,至多尿期与健康对照无显著性差异;急性期重型/危重型患者cf-DNA平均水平显著高于同期轻型/中型患者水平(p ＜0.001).健康人cf-DNA多为高分子量大片段DNA,而患者血浆cf-DNA高度富集于150 ～ 200 bp区域,显示为凋亡片段;血浆cf-DNA片段读长(reads)均匀分布于人类基因组的各条染色体,分布频度与染色体长度高度正相关(p＜0.001),且与HTNV病毒基因组无同源性.HFRS患者,急性期血浆cf-DNA即明显升高,并且随病程进展的不同分期与病情分型,呈现出动态变化的规律.HFRS患者血浆cf-DNA主要来源于疾病状态下,机体细胞发生凋亡后产生的基因组和线粒体DNA断裂片段,不包含HTNV病毒基因组成分.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张圆	第四军医大学免疫学教研室	23	96	5.0	9.0
2	金伯泉	第四军医大学免疫学教研室	232	1174	16.0	21.0
3	李琦	第四军医大学免疫学教研室	57	336	10.0	15.0
4	庄然	第四军医大学免疫学教研室	45	134	6.0	8.0
5	易静	第四军医大学免疫学教研室	30	68	4.0	6.0
6	马樱	第四军医大学免疫学教研室	14	65	4.0	7.0
7	孙艺祯	第四军医大学免疫学教研室	1	0	0.0	0.0
8	张宇丝	第四军医大学免疫学教研室	4	5	2.0	2.0