柯尔克孜族PPARG基因重组热点遗传定位及其与维吾尔族人群的比较分析

• 作者: 伊力哈木·乃扎木 多力坤·买买提玉素甫 宋曼殳 祖克拉·肉孜
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 过氧化物酶体增殖物激活受体 多态性,单核苷酸 连锁不平衡 重组热点
• 年，卷（期）: 2016,（31）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 2487-2492
• 页数: 6页
• 字数: 4449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2016.31.010

摘要

目的 分析探讨柯尔克孜族和维吾尔族两个人群过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)基因重组热点特征及连锁不平衡(LD)模式.方法 采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)方法对2013年8月采自新疆克孜勒苏柯尔克孜自治州阿图什市哈拉峻乡柯尔克孜族50例2型糖尿病患者(糖尿病组)、50名健康对照居民(健康对照组)和2012年5月采自新疆南疆和田地区的50名维吾尔族健康对照居民(维吾尔健康对照组)血液样品进行PPARG基因的31个标签单核苷酸多态性(taqSNP)位点的基因分型,采用Hotspot Fisher和Haploview软件推断该两个族群的PPARG基因重组热点特征及其LD模式.结果 柯尔克孜糖尿病组、健康对照组和维吾尔健康对照组均有18个tagSNP相同(rs1151999、rs1175540、rs1875796、rs1899951、rs2292101、rs2921190、rs2938397、rs2959272、rs2959273、rs2972162、rs3856806、rs4135247、rs4135275、rs709151、rs4135354、rs6805419、rs17036700、rs4135304),并在组间各个位点具有较高的重组率.LD分析结果显示,柯尔克孜健康对照组5个单体域的连锁不平衡系数(D')=1,处于完全的连锁不平衡状态,不发生重组.柯尔克孜糖尿病组5个单体域的连锁不平衡系数D'=0.91,D'＜1,说明两个位点间发生过重组.维吾尔健康对照组各4个单体域的连锁不平衡系数D'=1,处于完全的连锁不平衡状态,也说明此区域无重组热点.柯尔克孜族、维吾尔族PPARG重组热点图谱与HapMap图比较发现存在明显差异,在HapMap重组热点谱图中有6个重组热点,柯尔克孜族PPARG重组热点图谱最后5个SNP显示较低的重组率,而维吾尔族PPARG基因重组热点图谱中未发现重组热点.结论 在同一种族的糖尿病组与健康对照组或不同人群中在染色体某些区域的重组率变化可能存在很大差异,可能存在种群特异性的重组热点或同一热点位置的重组强度各不相同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋曼殳	首都医科大学公共卫生学院	26	109	5.0	9.0
2	多力坤·买买提玉素甫	新疆大学生命科学与技术学院	51	117	5.0	8.0
3	伊力哈木·乃扎木	新疆大学生命科学与技术学院	16	20	3.0	3.0
4	祖克拉·肉孜	新疆大学生命科学与技术学院	5	8	2.0	2.0