LC-MS/MS法测定药用植物基因组DNA甲基化水平Δ

• 作者: 文娟 李兆锦 蔡春 黄琼林
• 来源期刊: 中国药房
• 学科: 医学
• 关键词: DNA甲基化 液相色谱-质谱联用法 胞嘧啶 5-甲基胞嘧啶 药用植物
• 年，卷（期）: 2016,（16）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 2210-2212,2213
• 页数: 4页
• 分类号: R917
• 字数: 3454字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6039/j.issn.1001-0408.2016.16.15

摘要

目的：建立测定药用植物基因组DNA甲基化水平的液相色谱-串联质谱法（LC-MS/MS）。方法：采用试剂盒提取药用植物基因组DNA，并用88％甲酸在140℃下裂解DNA，经氮气吹干后，用流动相重新溶解。采用HILIC亲水作用色谱柱，以7 mmol/L甲酸铵水溶液-乙腈为流动相进行梯度洗脱，流速为0.3 ml/min。采用电喷雾离子源正离子模式进行监测，多反应监测（MRM）模式下进行定量分析，计算10种常见药用植物基因组的DNA甲基化率。结果：Cyt、5mC检测质量浓度线性范围分别为1～500（r＝0.9995）、0.2～100 ng/ml（r＝0.9996），精密度试验的RSD分别为1.12％和3.68％（n＝6），日内稳定性试验的RSD分别为2.36％和4.02％（n＝5），日间稳定性试验的RSD分别为1.04％和3.54％（n＝3），重复性试验的RSD分别为1.53％和3.27％（n＝6），方法回收率分别为98.7％～102.1％、91.2％～103.5％。10种药用植物基因组的DNA甲基化率在17.63％～25.18％之间。结论：LC-MS/MS法简便、快速、灵敏度高、精密度好，可用于药用植物基因组DNA甲基化水平的检测。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	文娟	广东医科大学分析中心	2	1	1.0	1.0
2	蔡春	广东医科大学分析中心	3	3	1.0	1.0
3	黄琼林	广东医科大学分析中心	7	12	3.0	3.0
4	李兆锦	广东医科大学分析中心	1	0	0.0	0.0