苦荞BAC文库的构建及BAC末端序列分析

• 作者: 孙伟 宋驰 徐长江 沈奇 石桃雄 陈庆富
• 来源期刊: 中药材
• 学科: 医学
• 关键词: 苦荞麦 细菌人工染色体文库 末端序列
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 资源与鉴别
• 页码范围: 510-514
• 分类号: R282.71
• 语种: 中文
• DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2016.03.011

摘要

目的:为了深入挖掘苦荞的基因组信息,筛选与苦荞品质相关的功能基因.方法:以苦荞品种“晋荞麦2号”为材料,参考Peterson等方法通过提取高分子量核DNA,经酶切、连接和转化构建苦养基因组BAC文库;随机挑选48个BAC克隆进行序列末端测序.结果:该文库包括30000个克隆,插入片段平均大小约为123kb,空载率小于1％,覆盖苦荞基因组6.9倍.共得到89条BAC末端序列,通过序列比对分析发现,7条(8％)有比对结果.其中,有末端序列与rpoTm2、Trrap、MDR1等已知基因相似,这些基因与DNA锚定,物质跨膜运输和磷酸转移酶活性等功能有关.分析还发现末端序列40G19-F可能是苦荞基因组的重复序列.结论:苦荞BAC文库构建为今后苦荞基因的克隆及全基因组测序奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈庆富	贵州师范大学荞麦产业技术研究中心	170	1308	15.0	28.0
2	孙伟	中国中医科学院中药研究所	42	186	8.0	11.0
3	石桃雄	贵州师范大学荞麦产业技术研究中心	25	59	4.0	6.0
4	沈奇	中国中医科学院中药研究所	4	32	2.0	4.0
5	宋驰	中国中医科学院中药研究所	2	0	0.0	0.0
6	徐长江	贵州师范大学荞麦产业技术研究中心	1	0	0.0	0.0