钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究

• 作者: 张达燕 徐鸿庄 沈平 苏齐鉴 蒋丽萍 郭继昌 韦建立 黄毅毅
• 来源期刊: 重庆医学
• 学科: 生物学
• 关键词: HIV-1 基因,gag 基因,pol 亚型 离散率 变异
• 年，卷（期）: 2016,（26）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 3605-3607
• 页数: 3页
• 分类号: Q786
• 字数: 2533字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-8348.2016.26.002

摘要

目的 调查流行于钦南区的HIV-1亚型种类并分析其基因变异特征.方法 抽取100例未抗病毒治疗的HIV-1感染者,从血样中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 gag基因和pol基因片段并测序,用系统进化树分析其亚型,并计算gag和pol区的基因离散率.结果 97份血样获得gag基因序列或pol基因序列,4份血样的gag与pol分型不一致,其他93份分型明确,其中CRF01_AE重组型、CRF07_BC重组型、CRF08 BC重组型及G亚型分别占76.34％(71/93)、9.68％(9/93)、12.90％(12/93)和1.07％(1/93).CRF08_BC的gag基因离散率为0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P＜0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P＜0.01).CRF01_AE的pol基因离散率为0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P＜0.01)和CRF08 BC的0.033±0.003(P＜0.01).结论 钦南区HIV-1存在至少3种流行亚型,其中CRF01_AE是最主要的亚型,不同基因区的变异程度有所不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏齐鉴		33	130	7.0	9.0
2	沈平		26	76	5.0	7.0
3	黄毅毅		6	27	3.0	5.0
4	蒋丽萍		8	22	3.0	4.0
5	郭继昌		4	4	2.0	2.0
6	张达燕		3	7	2.0	2.0
7	徐鸿庄		1	0	0.0	0.0