落葵薯DNA条形码筛选及其近缘植物的分子鉴定

• 作者: 叶永浩 李书渊 杨丽莹 苏荣坤 蔡宇忆
• 来源期刊: 中药材
• 学科: 医学
• 关键词: 落葵薯 DNA条形码 ITS ITS2 matK rbcL pbsA-trnH
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 资源与鉴别
• 页码范围: 1236-1240
• 分类号: R282.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2016.06.09

摘要

目的:利用DNA条形码鉴定落葵薯及其近缘植物.方法:对来自不同产地的28份落葵薯及其近缘植物的核基因ITS序列和ITS2序列、叶绿体基因matK序列、psb A-trnH序列和rbcL序列进行PCR扩增并测序,比较不同序列的PCR成功率及测序成功率,对各序列进行种内和种间变异分析,Barcoding gap检验,以及构建NJ树聚类分析,评估不同序列对落葵薯及其近缘植物的鉴别能力.结果:经PCR扩增、测序后发现落葵psb A-trnH序列出现碱基缺失事件,其他序列均扩增、测序成功;matK序列和rbcL序列的测序成功率均为100％,ITS序列和ITS2序列的测序成功率分别为78.75％和64.28％;4条序列中,ITS序列和matK序列的种内和种间距离分别在barcodinggap检验中明显分离;从NJ树来看,ITS序列、matK序列均可区分落葵薯及其近缘植物.结论:建议采用ITS序列及matK序列作为落葵薯及其近缘植物鉴定的DNA条形码.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李书渊		11	37	3.0	5.0
2	叶永浩		3	5	1.0	2.0
3	蔡宇忆		3	5	1.0	2.0
4	杨丽莹		3	5	1.0	2.0
5	苏荣坤		1	3	1.0	1.0