管状花目中多酚氧化酶的序列分析与功能预测

• 作者: 孙奕玥 张跃进 梁宗锁 舒志明 郭宏波
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 生物学
• 关键词: 管状花目 丹参 多酚氧化酶 序列分析 功能预测
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 85-91
• 分类号: Q946
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.201612022

摘要

以管状花目(Tubiflorae)中5个物种7个多酚氧化酶基因(PPO)序列为研究对象,采用序列对比分析和功能预测方法,研究了这些基因序列的碱基、酶蛋白氨基酸序列数量与比例,以及氨基酸序列中蛋白激酶C磷酸化、酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化、N-糖基化、N-豆蔻酰化、酰胺化、cAMP及cGMP蛋白激酶磷酰化6个功能位点结构域特征,以期揭示PPO酶调控的功能位点.结果表明:管状花目中丹参毛状根PPO基因含有G+C碱基最多,氨基酸中丙氨酸和亮氨酸含量也最高(16.9％),并含有最多的酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点(11个).丹参毛状根PPO酶不具备信号肽结构,有1个卷曲螺旋,是无跨膜结构的亲水性蛋白.该试验为研究PPO酶调控酚酸类物质次生代谢的分子机制,特别是蛋白与蛋白、蛋白与基因之间的互作奠定了基础.