高通量测序与传统纯培养方法在牡蛎微生物群落分析中的应用对比

• 作者: 刘淇 孟辉辉 张井 曹荣 赵玲
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 高通量测序 牡蛎 微生物群落结构
• 年，卷（期）: 2016,（24）
• 所属期刊栏目: 安全检测
• 页码范围: 137-141
• 页数: 5页
• 分类号: TS254.7
• 字数: 4321字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201624021

摘要

为揭示牡蛎体附着的微生物群落结构特征,采用Illumina HiSeq高通量测序技术对牡蛎的细菌种类进行了分析,并与传统纯培养方法的分析结果进行对比.结果表明,牡蛎体附着的细菌以变形菌门(Proteobacteria,77.5％)、y-变形菌纲(Gammaproteobacteria,72.3％)为主;在目的分类水平上,弧菌目(Vibrionales,49.3％)、交替单胞菌目(Alteromonadales,12.2％)占优势;在科的分类水平上,主要是弧菌科(Vibrionaceae,36.8％)、希瓦氏菌科(Shewanellaceae,10.3％)和交替假单胞菌科(Pseudoalteromonadaceae,7.2％);在属的分类水平上,弧菌属(Vibrio,28.3％)、希瓦氏菌属(Shewanella,10.3％)、交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas,7.2％)比例相对较高.高通量测序分析结果中,丰度前3位的菌属与纯培养鉴定的结果一致,但比例有所差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张井		11	82	5.0	8.0
2	曹荣	中国水产科学研究院黄海水产研究所	63	764	17.0	26.0
3	刘淇	中国水产科学研究院黄海水产研究所	114	1371	22.0	31.0
4	赵玲	中国水产科学研究院黄海水产研究所	36	234	8.0	14.0
5	孟辉辉	中国水产科学研究院黄海水产研究所	3	59	3.0	3.0