玉米磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶（PEPC）基因的克隆及序列分析

• 作者: 张跃强 李剑峰 樊哲儒 王重 高新
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: C4 植物 光合作用效率 PEPC 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（20）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 114-117
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 3343字
• 语种: 中文

摘要

[目的]获得玉米的PEPC基因，并对其生物信息学进行分析。[方法]使用RT－PCR方法由玉米中获得PEPC全长cDNA，构建克隆载体后进行测序，并对其序列进行生物信息学分析。[结果]获得的玉米PEPC基因CDS全长2913 bp，编码的多肽链包含970个氨基酸，为疏水性氨基酸，由α－螺旋（61．44％）、无规则卷曲（34．43％）和延伸链（4．12％）组成，定位于细胞质，不存在跨膜结构域，其175～970位氨基酸组成了磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的功能结构域，在173～184、597～609位具有2个磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶活性位点。[结论]该研究克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶（PPDK）基因，它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域。