长双歧杆菌NCC2705分泌蛋白的全基因组预测和功能分析

• 作者: 孟祥晨 岳丽红 朱德全 栗金柳 王茗悦 王长平 程广东 薛勇
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 长双歧杆菌 基因组 分泌蛋白 分泌途径 信号肽
• 年，卷（期）: 2016,（20）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 109-111,130
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 2945字
• 语种: 中文

摘要

以长双歧杆菌NCC2705基因组序列为研究对象，使用SignalP 4．0、LipoP、TMHMM 2．0软件分析该基因组中的分泌蛋白及其信号肽的类型，同时采用COG （ Cluster of Orthologous Groups of proteins）功能数据库对预测的分泌蛋白进行功能注释和聚类分析。结果表明，长双岐杆菌NCC2705中共有37个Sec途径分泌蛋白，其中Sec途径分泌蛋白包括27个被I型（ SPaseⅠ）信号肽酶和10个Ⅱ型信号肽酶（ SpaseII）识别的蛋白，Sec 途径分泌蛋白信号肽长度最多的有52个氨基酸，最少的有10个氨基酸。分泌蛋白的功能分析表明，该菌株分泌蛋白中含有大部分的假定蛋白，主要参与氨基酸代谢与转运、碳水化合物代谢转运，无机盐离子代谢转运，细胞壁和细胞膜生物合成的功能有关。