三元统计语言模型对基因表达载体设计的优化

• 作者: 张社民 方刚
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 合成生物学 统计语言模型 动态规划算法 合成生物学标准“零件”
• 年，卷（期）: 2016,（15）
• 所属期刊栏目: 理论与研发
• 页码范围: 60-64,140
• 页数: 6页
• 分类号: TP39
• 字数: 5185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.1604-0019

摘要

不断地将一些合成生物学标准“零件”以一定的标准装配，就可以得到由数十个功能片段组成的复杂表达载体。但是每一类的合成生物学标准“零件”数量众多，随着这些标准“零件”的不断开发，其数量也在进一步增加。在进行表达载体构建的最后阶段，从众多的“零件”中选择合适的以组装成功能性表达载体费时费力，并且容易发生错误。为解决这一问题，采用了自然语言处理的统计语言模型，并以该模型为基础应用动态规划算法优化表达载体设计，从众多的选项中找出最优者。利用这一方法可以减少进行生物学实验的冗余操作，从而减少表达载体构建过程中的花费。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方刚	西安文理学院生物与环境工程学院	9	2	1.0	1.0
2	张社民	西安财经学院信息学院	5	36	4.0	5.0