副猪嗜血杆菌中毒素蛋白基因hipA的生物信息学分析

• 作者: 刘玉涛 吴学敏 周伦江 王晨燕 王隆柏 车勇良 陈如敬
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 副猪嗜血杆菌 毒素蛋白 HipA蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 畜牧·动物医学·蚕·蜂
• 页码范围: 1-4
• 分类号: S852.612
• 语种: 中文

摘要

为预测毒素蛋白HipA的二级结构和B细胞抗原表位,首先从GenBank中查找副猪嗜血杆菌毒素蛋白基因hipA的序列,应用生物信息学方法,对副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的理化性质、二级结构和B细胞抗原表位进行预测.结果显示,HipA蛋白的理论等电点为7.23,前50个氨基酸为信号肽,二级结构的预测结果显示该酶主要以α螺旋、无规则卷曲和延伸链为主,只有少数的β转角;推测该蛋白有17个B细胞优势抗原表位区域.该研究为进一步研究分析副猪嗜血杆菌毒素蛋白HipA的功能奠定理论基础.