基于叶绿体ndhA基因内含子序列的DNA条形码在秋海棠属物种鉴定中的应用

• 作者: 唐文秀 李景剑 毛世忠 赵博
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 生物学
• 关键词: 秋海棠属 ndhA基因内含子 DNA条形码 物种鉴定
• 年，卷（期）: 2016,（16）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 103-107
• 分类号: Q948
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.201616027

摘要

以18种秋海棠属植物为试材,基于叶绿体ndhA基因内含子片段,利用Codon Code Aligner软件拼接序列后,通过MEGA软件进行比对并计算19个秋海棠属植物种间及种内遗传距离,最后利用邻接法构建分子系统树,研究了该片段作为DNA条形码对秋海棠属植物进行物种鉴定的可行性.结果表明:秋海棠属19个种类共59个个体的ndhA基因内含子序列长度为1 182 bp,在所考察的候选秋海棠属植物中具有最大的种间变异和较小的种内变异,且二者存在极显著差异.在系统树中,秋海棠属植物每一物种能够分别形成各自独立的分支,表现出良好单系性.基于ndhA基因内含子的DNA条形码在识别秋海棠属植物物种方面和传统形态学基本一致.该研究表明,以ndhA基因内含子作为秋海棠属植物DNA条形码进行物种鉴定具有一定的可行性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵博	中国科学院广西植物研究所	29	224	8.0	14.0
2	唐文秀	中国科学院广西植物研究所	17	171	9.0	12.0
3	李景剑	华南农业大学林学与风景园林学院	5	7	2.0	2.0
4	毛世忠	中国科学院广西植物研究所	7	51	4.0	7.0