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重庆市2009~2014年甲型 H1N1流感病毒分离株 HA基因变异分析
重庆市2009~2014年甲型 H1N1流感病毒分离株 HA基因变异分析
作者:
凌华
叶盛
喻臻
李勤
熊宇
陈爽
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甲型H1N1
流感病毒
序列分析
HA基因
摘要:
目的:对2009~2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行血凝素(HA)基因测序分析,与世界卫生组织(WHO)推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)比对,研究其基因变异情况。方法按分离时间及地点不同,选取47株2011~2014年分离得到的甲型H1N1流感病毒进行测序,同时选取既往已有的25株2009年甲型H1N1流感病毒的序列结果,经分子生物学软件进行核苷酸及氨基酸序列分析,并绘制系统进化树。结果2009、2011~2014年的新型甲型 H1N1流感病毒与疫苗株均位于一个大的分枝下,各病毒间的关系均较近。72株分离株的 H A基因总的核苷酸差异在0~2.7%之间,氨基酸差异在0~3.1%之间;与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)的核苷酸差异在0.4%~2.4%之间,氨基酸差异在0.9%~3.1%之间。氨基酸变异情况随着年份增加累积得更多,但在氨基酸序列上仍显示为低致病性流感病毒特征;2009年有9株病毒株丢失481位的糖基化位点,2013年有6株病毒株增加位于162位的糖基化位点。结论 WHO推荐的甲型 H1N1疫苗总体上对重庆地区的人群仍有较好的保护作用,但随着时间推移,部分甲型 H1N1流感病毒株可能已发生抗原漂移,需继续对其监测。
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降维
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甲型流感病毒
血凝素
序列分析
进化树
基于 H1N1型禽流感病毒的 HA蛋白序列进化树研究
H1N1 病毒
HA蛋白序列
模糊邻近关系
结构聚类
进化树
内容分析
文献信息
引文网络
相关学者/机构
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期刊文献
内容分析
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文献信息
篇名
重庆市2009~2014年甲型 H1N1流感病毒分离株 HA基因变异分析
来源期刊
重庆医学
学科
医学
关键词
甲型H1N1
流感病毒
序列分析
HA基因
年,卷(期)
2016,(30)
所属期刊栏目
论著?临床研究
研究方向
页码范围
4226-4229
页数
4页
分类号
R373.1+3
字数
4342字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1671-8348.2016.30.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李勤
重庆市疾病预防控制中心传染病预防控制所
60
412
12.0
16.0
2
凌华
重庆市疾病预防控制中心微生物检测所
69
441
11.0
17.0
3
熊宇
重庆市疾病预防控制中心传染病预防控制所
8
37
4.0
6.0
4
陈爽
重庆市疾病预防控制中心微生物检测所
7
36
4.0
6.0
5
叶盛
重庆市疾病预防控制中心微生物检测所
5
26
3.0
5.0
6
喻臻
重庆市疾病预防控制中心微生物检测所
4
25
3.0
4.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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参考文献
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节点文献
引证文献
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同被引文献
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甲型H1N1
流感病毒
序列分析
HA基因
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相关学者/机构
期刊影响力
重庆医学
主办单位:
重庆市卫生信息中心
重庆市医学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1671-8348
CN:
50-1097/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市渝北区宝环路420号
邮发代号:
78-27
创刊时间:
1972
语种:
chi
出版文献量(篇)
30732
总下载数(次)
32
总被引数(次)
193615
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