泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因序列的遗传多样性分析

• 作者: 付佩胜 巩俊霞 张金路 李娴 杨玲
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 泰山螭霖鱼 COⅠ 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（27）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 127-130
• 页数: 4页
• 分类号: S917|Q958.1
• 字数: 3670字
• 语种: 中文

摘要

[目的]通过克隆泰山螭霖鱼的COⅠ基因序列，研究其与鲤科几属鱼类的进化关系，确定泰山螭霖鱼的分类地位。[方法]以泰山螭霖鱼30个个体为材料，对其线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（ COⅠ）的部分序列进行PCR扩增和序列对比，检测泰山螭霖鱼的遗传多样性；计算泰山螭霖鱼不同单倍型与GenBank中鲤科5个属鱼类的遗传距离，采用聚类分析方法，构建NJ和UPGMA系统进化树。[结果]30个个体泰山螭霖鱼线粒体COⅠ基因片段长度约1600 bp，无碱基的插入和缺失，纯化并去除引物序列后获得约1493 bp的核苷酸序列，存在6种单倍型，共检测到6个多态位点，包括4个转化、2个颠换，其单倍型多样性（Hd）为0．460，核苷酸多样性（Pi）为0．00078，平均核苷酸差异数（K）1．163。遗传距离和NJ和UPGMA系统进化树表明，泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的COⅠ序列一致，泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近，与金线鲃属、倒刺鲃属、华鲮属的亲缘关系较远。[结论]该研究为其种质资源的管理与保护及遗传育种提供分子生物学依据。