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胃癌组织 ATP1 A2的表达及机制探讨
胃癌组织 ATP1 A2的表达及机制探讨
作者:
侯科佐
刘云鹏
曲秀娟
李智
王硕
臧丹
车晓芳
郑春雷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
胃癌
癌症基因组图谱
人类肿瘤相关基因表达汇编
ATP酶α2亚基
摘要:
目的:观察胃癌组织ATP酶α2亚基( ATP1A2)表达情况,探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱( TCGA)数据库下载并预处理胃癌RNASeqV2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇编( GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,通过TCGA数据集纳入胃癌患者293例,通过GEO数据集纳入胃癌患者300例。根据表达谱数据,将胃癌组织ATP1A2表达由低到高排序,按33%、67%者将数据三等分,低于33%者为低表达,高于67%者为高表达,两者之间为中表达。分析不同ATP1A2表达与胃癌患者临床病理参数的关系,比较低、中、高表达者中位生存时间,利用基因集富集分析方法预测ATP1A2相关的基因通路。结果 TCGA数据集纳入的293例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为95、99、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄无关(P均>0.05),与T分期、N分期、pTNM分期及组织分化程度有关(P均<0.05);ATP1A2低、中、高表达者中位生存时间分别为70、36.9和26个月,三者间比较P<0.01。 GEO数据集纳入的300例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为99、102、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄、T分期、N分期、pTNM分期及Lauren分型均有关(P均<0.05);ATP1A2高表达者的中位生存时间为31个月,较低表达和中表达者中位生存时间明显延长(P<0.01)。 ATP1A2高表达富集了黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等相关的基因通路(P<0.05或<0.01)。结论胃癌组织中ATP1A2高表达,其高表达预示患者预后不良;ATP1A2高表达导致黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等基因通路异常可能是其作用机制。
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文献信息
篇名
胃癌组织 ATP1 A2的表达及机制探讨
来源期刊
山东医药
学科
医学
关键词
胃癌
癌症基因组图谱
人类肿瘤相关基因表达汇编
ATP酶α2亚基
年,卷(期)
2016,(24)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
5-8
页数
4页
分类号
R735.2
字数
2811字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1002-266X.2016.24.002
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘云鹏
299
1742
18.0
25.0
2
李智
91
554
14.0
20.0
3
曲秀娟
107
483
12.0
15.0
4
侯科佐
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5
王硕
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臧丹
1
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郑春雷
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节点文献
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癌症基因组图谱
人类肿瘤相关基因表达汇编
ATP酶α2亚基
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山东医药
主办单位:
山东卫生报刊社
出版周期:
周刊
ISSN:
1002-266X
CN:
37-1156/R
开本:
大16开
出版地:
济南市燕东新路6号
邮发代号:
24-8
创刊时间:
1957
语种:
chi
出版文献量(篇)
55362
总下载数(次)
42
总被引数(次)
199298
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