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摘要:
目的:观察胃癌组织ATP酶α2亚基( ATP1A2)表达情况,探讨其与黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子通路、细胞外基质相关信号通路的关系。方法从癌症基因组图谱( TCGA)数据库下载并预处理胃癌RNASeqV2数据、从人类肿瘤相关基因表达汇编( GEO)数据库下载胃癌样本数据集GSE62254的series matrix数据,通过TCGA数据集纳入胃癌患者293例,通过GEO数据集纳入胃癌患者300例。根据表达谱数据,将胃癌组织ATP1A2表达由低到高排序,按33%、67%者将数据三等分,低于33%者为低表达,高于67%者为高表达,两者之间为中表达。分析不同ATP1A2表达与胃癌患者临床病理参数的关系,比较低、中、高表达者中位生存时间,利用基因集富集分析方法预测ATP1A2相关的基因通路。结果 TCGA数据集纳入的293例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为95、99、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄无关(P均>0.05),与T分期、N分期、pTNM分期及组织分化程度有关(P均<0.05);ATP1A2低、中、高表达者中位生存时间分别为70、36.9和26个月,三者间比较P<0.01。 GEO数据集纳入的300例胃癌患者中,ATP1A2低、中、高表达者分别为99、102、99例;不同ATP1A2表达与胃癌患者性别、年龄、T分期、N分期、pTNM分期及Lauren分型均有关(P均<0.05);ATP1A2高表达者的中位生存时间为31个月,较低表达和中表达者中位生存时间明显延长(P<0.01)。 ATP1A2高表达富集了黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等相关的基因通路(P<0.05或<0.01)。结论胃癌组织中ATP1A2高表达,其高表达预示患者预后不良;ATP1A2高表达导致黏着斑通路、细胞黏附分子、钙离子信号通路、细胞外基质等基因通路异常可能是其作用机制。
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文献信息
篇名 胃癌组织 ATP1 A2的表达及机制探讨
来源期刊 山东医药 学科 医学
关键词 胃癌 癌症基因组图谱 人类肿瘤相关基因表达汇编 ATP酶α2亚基
年,卷(期) 2016,(24) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 5-8
页数 4页 分类号 R735.2
字数 2811字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1002-266X.2016.24.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 刘云鹏 299 1742 18.0 25.0
2 李智 91 554 14.0 20.0
3 曲秀娟 107 483 12.0 15.0
4 侯科佐 117 599 12.0 16.0
5 王硕 17 44 5.0 6.0
6 臧丹 1 4 1.0 1.0
7 郑春雷 5 12 3.0 3.0
8 车晓芳 14 19 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
胃癌
癌症基因组图谱
人类肿瘤相关基因表达汇编
ATP酶α2亚基
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
山东医药
周刊
1002-266X
37-1156/R
大16开
济南市燕东新路6号
24-8
1957
chi
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55362
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199298
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