乳酸菌CRISPR-Cas系统同源性分析

• 作者: 张丹青 李婉 王娜娜 霍贵成
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 乳酸菌 clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR)-Cas系统 同源性 重复序列 间隔序列
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 134-140,146
• 页数: 8页
• 分类号: TS252.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2016.11.020

摘要

CRISPR-Cas系统为乳酸菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,利用生物信息学方法分析了CRISPR序列及cas基因在乳酸菌种间的同源性关系.利用生物信息学方法预测NCBI中已测序的部分乳酸菌所含CRISPR-Cas系统,并对重复序列和Cas蛋白序列进行系统发生学分析.结果显示,嗜热链球菌、德氏乳杆菌和瑞士乳杆菌标准菌株均含不同数目的CRISPR-Cas系统,各类型的重复序列高度保守,Cas蛋白序列同源性较高.CRISPR-Cas系统的同源性与其亚型密切相关,而与菌种亲缘关系有较大差异,证明了CRISPR-Cas系统能够通过基因水平转移传播这一结论.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	霍贵成	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	347	3533	30.0	41.0
2	李婉	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	12	74	3.0	8.0
3	王娜娜	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	17	64	4.0	7.0
4	张丹青	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	5	6	2.0	2.0