基于POA有向无环图及隐马尔科夫模型的优化PHMM算法

• 作者: 孙启明 王靖会
• 来源期刊: 农业与技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 序列比对 POA有向无环图 隐马尔科夫模型 PHMM算法
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 农业科学
• 页码范围: 33-34,37
• 页数: 3页
• 分类号: Q811.2
• 字数: 2635字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11974/nyyjs.20160532013

摘要

随着基因组计划的实施,大量的基因组数据被测序,如何从海量数据中提取出有用的生物学信息,成为生物信息学研究中的重点.序列比对是生物信息学研究的基本方法和主要手段,目前已经有很多比对算法,但如何提高算法敏感性及准确性,仍旧是一个难题.基于这种情况,本文基于POA有向无环图算法及隐马尔科夫模型,创新性的提出一种新的算法PHMM算法,这种算法打破传统的线性序列比对,采用了一种基于图论的渐进比对算法,对参数选择具有一定先进性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王靖会	吉林农业大学信息技术学院	26	71	4.0	6.0
2	孙启明	吉林农业大学信息技术学院	1	0	0.0	0.0