佛手瓜鲨烯合酶基因克隆及酶分子结构分析

• 作者: 刘永明 吴耀生 梁斌 肖雅伦 苏何玲 谭燕莲 谷云艳
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 佛手瓜 鲨烯合酶 基因克隆 结构分析
• 年，卷（期）: 2016,（32）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 142-146
• 页数: 5页
• 分类号: S188|Q946.83
• 字数: 4278字
• 语种: 中文

摘要

[目的]克隆佛手瓜鲨烯合酶（ SQS）基因，并基于克隆的SQS序列分析该酶的分子结构，为佛手瓜生物活性成分的利用提供理论依据。[方法]根据SQS基因5′末端保守序列和3′race方法扩增的佛手瓜SQS基因3′末端序列设计佛手瓜SQS基因克隆引物。扩增的佛手瓜SQS基因片段插入pGEM－T Easy Vector后经DNA测序。应用生物信息学方法分析克隆序列的开放阅读框架（ ORF）、酶蛋白的疏水性／亲水性和蛋白质磷酸化位点，预测酶蛋白的二级结构、结构域、三级结构和跨膜区。以布朗葡萄藻为outgroup，应用MEGA 5．0进行UPGMA算法构建系统树，并进行1000次的Bootstrap 测试。[结果]佛手瓜SQS由417氨基酸残基构成，等电点为6．983。构象预测提示该酶二级结构以α螺旋为主，是一种只有三级结构的单体酶，其活性中心是主要由几个α螺旋围绕形成的穴状结构，酶蛋白肽链中具有1个跨膜区。结构域分析表明SQS属于异戊二烯合酶家族。磷酸化位点分析显示该酶共有17个磷酸化位点，其中，S48位于与酶活性中心相关模体中，而S196为陆生植物SQS基因的正选择位点。以佛手瓜SQS基因ORF序列构建系统发生树得到的系统发生分类结果与形态学分类结果一致。[结论]佛手瓜SQS是由417氨基酸残基构成的单体酶，具有1个跨膜区和17个磷酸化位点，其中，S48和S196可能是佛手瓜SQS酶活性调节的关键性磷酸化位点。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘永明	桂林医学院医药生物技术重点实验室	56	174	7.0	10.0
2	苏何玲	广西医科大学生物化学与分子生物学教研室	35	153	6.0	11.0
4	梁斌	桂林医学院医药生物技术重点实验室	11	26	4.0	5.0
5	谭燕莲	桂林医学院医药生物技术重点实验室	5	1	1.0	1.0
6	谷云艳	桂林医学院医药生物技术重点实验室	2	1	1.0	1.0
9	肖雅伦	桂林医学院医药生物技术重点实验室	1	1	1.0	1.0