小白杏脂氧合酶基因PaLOX的克隆与序列分析

• 作者: 吴忠红 吴斌 张平 杜鹃 谭慧林 阿塔吾拉·铁木尔
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 小白杏 脂氧合酶 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-8,16
• 页数: 9页
• 分类号: S662.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2017.01.0001

摘要

[目的]克隆小白杏(Prunus armeniaca)PaLOX基因全长并对其进行序列分析.[方法]根据已有的ESTs序列,设计3'和5'端RACE引物,利用RT-PCR和RACE技术克隆小白杏PaLOX基因cDNA全长.[结果]PaLOX cDNA全长序列为2 723 bp,含有一个1 002 bp的ORF开放阅读框,编码334个氨基酸,含有PLAT高度保守的特异结构域,预测蛋白质的相对分子质量为26.558 1 kDa,推测理化等电点为8.77,分子式为C1689H2635N459O490S13;该蛋白主要表现为亲水性,α-螺旋和延伸链则散布于整个蛋白质中,空间结构不稳定,无信号肽和跨膜结构,可能存在于线粒体中.进化分析表明,PaLOX氨基酸序列与梅、碧桃、苹果、梨、草莓等蔷薇科聚为一类,相似性依次为98％、99％、78％、77％、63％.[结论]获得了编码小白杏脂氧合酶的基因PaLOX全长序列,登录号为KM067451.