重构符合自然历史的演化树是系统生物学的终极目标

• 作者: 任东
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 单系 并系 分支分析 自然历史 自然分类系统
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 699-709
• 页数: 11页
• 分类号: Q969
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2017.06.010

摘要

从自然历史的角度,对单系群、特征、系统发育和自然分类系统的概念做出了澄清和解释.自然分类是仅包含单系群全体成员和它们之间亲缘发育关系和自然演化过程的分类.只有包括所有成员在内的单系群才能称为一个自然分类系统.目前生物系统学主要使用分支分析方法重建自然历史演化过程.在编写算法语言和程序时,作者常将注意力集中在形态和分子数据的获得、运算过程和算法的改进,而忽略了支序分类学的简约原则等假设前提和它的理论缺陷.由此在系统发育重建的过程中存在2个常见的误区:(1)在一个单系类群中包括的成员不完全却声称是一个自然系统;(2)将通过数学和程序运算出来的“简约”或最“似然”的亲缘发育关系当作自然系统.自然单系类群往往具有漫长的演化历史,人类无法直接观察和在实验室中重复.利用支序分类原理构建的单系类群的发育关系只是一个单系类群之间的最“简约”或最“似然”的亲缘发育关系,并不能真正反映自然历史的本来面目.古生物学虽然有较好的时空框架,但可提供的特征数量和精度不够.现生生物的各种特征和遗传数据虽然相对充分,但对于具有较长演化历史的类群,由于缺失了大量关键成员,推导出的系统发育关系可能都是并系或复系,无法构成一个自然系统.因此只用现生生物宏观和基因组信息重构具有较长演化历史的生物类群的自然系统是无法实现的.只有利用分子和形态的全证据,从宏观和微观两个层面、古代和现代相结合,采用多种技术和研究手段对一个单系类群的全体成员进行研究,才能真正做到自然分类.在这个过程中可以利用6个原则对分类系统是否符合自然历史发展进行检验.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任东	首都师范大学生命科学学院	74	266	7.0	14.0