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香蕉海藻糖合成酶基因(MaTPS5)生物学及表达特性分析
香蕉海藻糖合成酶基因(MaTPS5)生物学及表达特性分析
作者:
孙佩光
李科明
王安邦
舒海燕
许桂莺
贾彩红
邢文婷
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
香蕉
海藻糖-6-磷酸合成酶基因5(TPS5)
生物信息学
表达分析
摘要:
通过研究香蕉MaTPS5基因的生物学功能,探讨海藻糖合成酶基因在香蕉植株抗逆反应中的作用.利用随机克隆测序法从香蕉根系转录组中获得海藻糖合成酶基因,命名为MaTPS5.生物信息学分析表明,MaTPS5全长cDNA序列3 081 bp,完整开放阅读框2 559 bp,编码852个氨基酸;MaTPS5蛋白属于不稳定、疏水性蛋白,等电点pI6.52,有两个结构域GT1-TPS和TPP,定位于细胞质中,含2个跨膜区域,不存在信号肽;与已知植物TPS氨基酸序列同源性达到77.31%;进化分析表明,香蕉MaTPS5氨基酸序列与野蕉TPS氨基酸序列聚为一类,说明二者亲缘关系较近,具有共同的祖先.组织特异性表达研究表明MaTPS5在球茎、叶、花中表达量较高,在根中表达量最低.qRT-PCR分析表明,MaTPS5响应激素ACC和盐的处理,表达量在24h均达到极显著水平.在Foc TR4病原菌处理后,表达量升高,并在3个时段保持一致.结果表明,MaTPS5可能依赖乙烯信号传导途径诱导自身表达,合成海藻糖,参与香蕉抗逆反应.
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文献信息
篇名
香蕉海藻糖合成酶基因(MaTPS5)生物学及表达特性分析
来源期刊
生物技术通报
学科
关键词
香蕉
海藻糖-6-磷酸合成酶基因5(TPS5)
生物信息学
表达分析
年,卷(期)
2017,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
118-124
页数
7页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2017.02.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
贾彩红
中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所
26
114
7.0
10.0
2
邢文婷
7
13
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
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引证文献(2)
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2020(1)
引证文献(0)
二级引证文献(1)
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节点文献
香蕉
海藻糖-6-磷酸合成酶基因5(TPS5)
生物信息学
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物技术通报
主办单位:
中国农业科学院农业信息研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-5464
CN:
11-2396/Q
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区中关村南大街12号
邮发代号:
18-92
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
7180
总下载数(次)
42
总被引数(次)
53964
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