环境微生物组多样性及功能研究进展

• 作者: 于玲 仇荣亮 何强 冯凯 原珂 吴波 栾天罡 汪善全 罗丽娟 职晓阳 肖凡书 许玫英 贺志理 连英丽 邓晔 陈保卫 颜庆云 鲁祺鸿
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 地球科学
• 关键词: 环境微生物组 微生物功能 宏基因组 生物信息学工具
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 1-11
• 页数: 11页
• 分类号: X172
• 字数: 9028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13471/j.cnki.acta.snus.2017.05.001

摘要

快速发展的测序技术和各种高通量手段使我们能够深入探索环境微生物的多样性及其功能.本文中提及的环境微生物组(environmental microbiome)界定为特定环境中所有微生物基因组的集合.环境微生物组研究的主要目的是解读特定环境中微生物的多样性、结构、功能、相互作用和进化,以及它们与环境因子和生态系统功能之间的关系等.本文重点关注土壤、水体及空气中的微生物组研究,回顾了目前的高通量测序技术和主要的环境微生物组学数据分析工具,然后综述了不同的生态环境中微生物组研究的主要的进展,最后,提出了环境微生物组研究中的关键科学问题,并突出了在未来环境微生物组研究中微生物功能和生态机制的重要性.