我国羊巴贝斯虫trap基因结构及遗传进化分析

• 作者: 何欣 关贵全 刘军龙 刘爱红 李有全 殷宏 牛庆丽 王锦明 罗建勋
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊巴贝斯虫 trap基因 基因结构 系统发生树
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1332-1341
• 页数: 10页
• 分类号: S852.723
• 字数: 7282字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.07.018

摘要

本研究拟解析我国羊巴贝斯虫trap基因的结构特征,并以其为分子标志开展遗传进化分析,为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据.用公布的巴贝斯虫trap基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库,以获得的保守序列片段为模板,设计PCR引物;克隆我国分离的6株羊巴贝斯虫trap基因全长序列,分析其序列结构特征;比对序列相似性,构建系统发生树,分析其遗传进化关系.结果克隆获得6株羊巴贝斯虫trap基因,分析结果显示,其具有3、4、5个内含子的三种内含子数目,预测的开放阅读框(ORF)大小分别为1 944、2 100/2 142和2 286 bp;氨基酸序列分析显示,其都具有TRAP蛋白家族特征性的vWFA、TSR、跨膜域和CTD结构域;进化关系分析显示,感染我国羊的巴贝斯虫被分成3组,组内序列相似性为99.8％～100％,而组间为43.6％～74.6％.系统发生树上6株羊巴贝斯虫被分到两大枝,羊巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫,而且莫氏巴贝斯虫又被分成两小枝.6株羊巴贝斯虫trap基因结构存在差异,但其蛋白特征性的结构域较为保守;我国分离的羊巴贝斯虫为两个种,但莫氏巴贝斯虫中可能存在两个亚种.