陆地棉Pht1家族成员的全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 宋海娜 张志勇 张新 张金宝 晁毛妮 李成奇 王清连 胡根海
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 基因家族 GhPT基因 磷酸盐转运蛋白 进化分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 59-69
• 页数: 11页
• 分类号: S562.03
• 字数: 6804字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201701007

摘要

[目的]磷是植物三大必需矿质元素之一,对植物的生长发育至关重要.Pht1家族的磷酸盐转运蛋白在植物磷吸收和转运方面具有重要作用,然而关于该基因的系统研究工作尚很少开展.本研究旨在进行Pht1家族成员全基因组鉴定和表达模式分析.[方法]通过生物信息学的方法对陆地棉Pht1家族成员的基因结构、编码蛋白质的结构、染色体定位、基因复制和表达情况等进行全面分析.[结果](1)在陆地棉的基因组中共鉴定到17个磷酸盐转运蛋白基因(GhPT),其中A亚组包含8个GhPT,D亚组包含9个GhPT;(2)棉花GhPT蛋白之间序列相似性很高,并均具有12个疏水的跨膜区域;(3)进化分析表明这些GhPT蛋白主要聚为2大组(Group Ⅰ和GroupⅡ),位于同一组的GhPT的编码基因大部分具有相似的内含子/外显子分布模式;(4)17个GhPT基因不均匀分布在A亚组和D亚组中的5条染色体上,串联复制和片段复制可能导致GhPT基因在陆地棉中的扩增;(5)表达模式分析表明,GhPT6和GhPT14在根中表达量最高,且同时响应低磷和低钾胁迫诱导并上调表达.[结论]这些结果将有助于深入了解Pht1家族基因的功能及离子信号途径相互作用的分子机制.