斑点叉尾鮰BPI1基因的原核表达及生物信息学分析

• 作者: 朱劼垚 杨倩 汪开毓 王二龙 王兴丽 贺扬 陈德芳
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 斑点叉尾鮰 BPI1基因 原核表达 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 1-10
• 分类号: Q785|S941.42
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20160410336

摘要

为探究斑点叉尾鮰BPI1抗菌肽基因编码蛋白的结构特征,实验提取斑点叉尾鮰肾脏RNA,根据BPI1基因序列设计引物,利用PCR方法克隆BPI1基因并构建至原核表达载体pTWIN1中.构建成功的重组质粒pTWIN1-BPI1经原核表达,SDS-PAGE检测显示得到约为50ku的融合蛋白,与预期结果相一致.通过生物信息学软件对BPI1基因编码的蛋白序列进行分析,结果显示,克隆所得斑点叉尾鮰BPI1基因编码一条由223个氨基酸残基组成的多肽,等电点为9.07,属于BPI超家族,是稳定的亲水蛋白.亚细胞定位BPI1分布在线粒体(43.5％)、细胞质(30.4％)和细胞核(26.1％)中,表明BPI1可能在嘌呤和嘧啶合成以及能量代谢等过程中发挥信号转导、促进生长等重要作用.二级结构以α-螺旋和β-折叠为主,三级结构呈棒状.同源性及进化树分析表明,实验所得BPI1基因序列与斑点叉尾鮰BPI抗菌肽基因的同源性最高,序列一致性为99.1％,进化树聚为一支,表明BPI1基因编码的蛋白序列在相同物种中的突变率较低,保守性较高,相同物种中其生物活性与个体间的差异关系较小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪开毓	四川农业大学鱼病研究中心	270	2400	27.0	35.0
5	陈德芳	四川农业大学动物科技学院	90	637	14.0	21.0
6	王二龙	四川农业大学鱼病研究中心	13	28	3.0	4.0
7	王兴丽	四川农业大学鱼病研究中心	8	12	2.0	3.0
8	杨倩	四川农业大学鱼病研究中心	17	28	2.0	5.0
9	贺扬	四川农业大学鱼病研究中心	8	20	2.0	4.0
10	朱劼垚	四川农业大学动物科技学院	2	8	1.0	2.0