肌肉生长抑制素(MSTN)是动物肌肉发育和生长过程中的负调控因子.为了明确淇河鲫MSTN基因序列及其在肌肉生长发育中的调控功能,本研究利用RACE方法克隆淇河鲫MSTN全长cDNA序列,qRT-PCR分析其在不同组织和胚胎发育阶段的表达情况.结果显示,淇河鲫MSTN cDNA序列全长2094 bp (no.KC851952.1),包含86 bp 5’非编码区、880 bp 3’非编码区和1128 bp开放阅读框,编码375个氨基酸残基,前22个氨基酸残基为信号肽,34~256位氨基酸残基为TGF-β前肽域,281~375是TGF-β结构域,具蛋白酶水解位点RIRR和C端生物活性区的9个保守半胱氨酸残基.蛋白同源分析发现淇河鲫MSTN与鲤形目鱼类相似性较高,与哺乳动物和鸟类的相似性最低.系统进化分析显示,淇河鲫MSTN与鲫、鲤、鳡等鲤科鱼类亲缘关系较近.实时定量PCR分析表明,淇河鲫MSTN基因在各个组织中均有表达,脑中表达量最高,其次为肌肉和肝脏,肠道表达量最低.淇河鲫胚胎发育的各阶段MST基因均有表达,受精卵表达量最高,其次为囊胚期,神经胚期表达量最低.推测MSTN与淇河鲫肌肉发育生长具有一定的相关性,可能参与“双背鲫”特征的形成.